Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTRT1Q8TDG2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms