Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3IL1Q8TBN0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms