Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL4L1Q8NHW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms