Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNL1Q8NG31 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms