Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEST2Q8NFU1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms