Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHBP1Q8NDI1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHBP1Q8NDI1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHBP1Q8NDI1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHBP1Q8NDI1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHBP1Q8NDI1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHBP1Q8NDI1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHBP1Q8NDI1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EHBP1Q8NDI1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHBP1Q8NDI1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms