Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMG8Q8ND04 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG8Q8ND04 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms