Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC197Q8NCU1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms