Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACBD4Q8NC06 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms