Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM1BQ8NB78 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1BQ8NB78 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 480.7 ms