Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSIP1Q8NA03 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms