Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC4Q8N9L1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 468.7 ms