Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NECAB1Q8N987 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECAB1Q8N987 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECAB1Q8N987 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms