Protein–RNA interactions for Protein: Q8N819

PPM1N, Probable protein phosphatase 1N, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1NQ8N819 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1NQ8N819 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms