Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 KCNMA1-245ENST00000638759 3723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.756e-8■■■■■ 28.7
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AGGF1Q8N302 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 28.7
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AGGF1Q8N302 KCNMA1-228ENST00000638223 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.846e-8■■■■■ 28.7
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AGGF1Q8N302 KCNMA1-288ENST00000640773 3481 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.43□□□□□ -0.96e-8■■■■■ 28.7
AGGF1Q8N302 KCNMA1-275ENST00000639995 3464 ntTSL 59.32□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 28.7
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AGGF1Q8N302 KCNMA1-247ENST00000638895 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.57□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 28.7
AGGF1Q8N302 KCNMA1-214ENST00000434208 4055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 28.7
AGGF1Q8N302 KCNMA1-271ENST00000639823 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.48□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 28.7
AGGF1Q8N302 KCNMA1-207ENST00000372437 3751 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.44□□□□□ -1.066e-8■■■■■ 28.7
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AGGF1Q8N302 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.486e-8■■■■■ 28.7
AGGF1Q8N302 STT3A-202ENST00000524639 582 ntTSL 25.24□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 28.7
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AGGF1Q8N302 STT3A-208ENST00000526726 582 ntTSL 34.81□□□□□ -1.643e-8■■■■■ 28.7
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AGGF1Q8N302 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 28.5
AGGF1Q8N302 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.659e-8■■■■■ 28.5
AGGF1Q8N302 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.079e-8■■■■■ 28.5
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AGGF1Q8N302 SNX2-202ENST00000505854 908 ntTSL 217.72■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 28.3
AGGF1Q8N302 SNX2-211ENST00000512394 763 ntTSL 316.49■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 28.3
AGGF1Q8N302 SNX2-203ENST00000505934 819 ntTSL 214.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 28.3
AGGF1Q8N302 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 28.3
AGGF1Q8N302 MTSS1-205ENST00000518547 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 28.3
AGGF1Q8N302 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 28.3
AGGF1Q8N302 MTSS1-212ENST00000522162 553 ntTSL 46.81□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 28.3
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AGGF1Q8N302 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.011e-8■■■■■ 28.2
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AGGF1Q8N302 SLC2A11-214ENST00000467660 1203 ntTSL 1 (best)20.34■□□□□ 0.851e-8■■■■■ 28.2
AGGF1Q8N302 SLC2A11-218ENST00000482576 558 ntTSL 220.32■□□□□ 0.841e-8■■■■■ 28.2
AGGF1Q8N302 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 28.2
AGGF1Q8N302 SLC2A11-220ENST00000489322 2406 ntTSL 219.44■□□□□ 0.71e-8■■■■■ 28.2
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AGGF1Q8N302 SLC2A11-216ENST00000473357 2787 ntTSL 218.06■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 28.2
AGGF1Q8N302 SLC2A11-213ENST00000461809 3054 ntTSL 516.74■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 28.2
AGGF1Q8N302 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 28.2
AGGF1Q8N302 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 28.2
AGGF1Q8N302 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 28.2
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