Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms