Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP3Q8IZU3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms