Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVG5

SAMD9L, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9LQ8IVG5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SAMD9LQ8IVG5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SAMD9LQ8IVG5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SAMD9LQ8IVG5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms