Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA4Q8IV77 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms