Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms