Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX20Q7Z614 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms