Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3Q7Z3Z2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms