Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms