Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDPD3Q7L5L3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms