Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP6Q6ZN66 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms