Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOCD1Q6ZMY3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms