Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LBX2Q6XYB7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms