Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX40

TMEM107, Transmembrane protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM107Q6UX40 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM107Q6UX40 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM107Q6UX40 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms