Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKN3Q6P5Z2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms