Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC41PQ6P2S7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms