Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EDC4Q6P2E9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EDC4Q6P2E9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
EDC4Q6P2E9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDC4Q6P2E9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
EDC4Q6P2E9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDC4Q6P2E9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDC4Q6P2E9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDC4Q6P2E9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
EDC4Q6P2E9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EDC4Q6P2E9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
EDC4Q6P2E9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 278.4 ms