Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RINT1Q6NUQ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RINT1Q6NUQ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RINT1Q6NUQ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms