Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC70Q6NSX1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC70Q6NSX1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms