Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTRHD1Q6GMV3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms