Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFRP4Q6FHJ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP4Q6FHJ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms