Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms