Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC102BQ68D86 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC102BQ68D86 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms