Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPL2Q5VXT5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYPL2Q5VXT5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPL2Q5VXT5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms