Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SUSD4Q5VX71 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms