Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWT1Q5T5J6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms