Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN11Q5T124 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms