Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HP1BP3Q5SSJ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HP1BP3Q5SSJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms