Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms