Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR44Q5JSH3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms