Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
XKR3Q5GH77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms