Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK2Q5EBM0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms