Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN4Q5BKX8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms