Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms