Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms