Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF394Q53GI3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms